Mengapa sebagian besar pembatasan enzim memotong pada urutan palindromik?

Mengapa sebagian besar pembatasan enzim memotong pada urutan palindromik?
Anonim

Menjawab:

Karena lebih efisien.

Penjelasan:

Enzim seperti enzim restriksi harus mengenali urutan yang sangat spesifik untuk menjalankan tugasnya. Itu mengikat DNA hanya dalam satu konfigurasi spesifik. Untunglah! karena Anda tidak ingin 'pacman' yang memotong DNA di tempat acak.

DNA beruntai ganda, sehingga memiliki 'dua sisi' di mana enzim dapat mengikat. Urutan palindromik adalah sama mundur dan maju di kedua sisi (lihat gambar di bawah). Ini berarti bahwa enzim mengenali urutan tidak peduli dari sisi mana enzim mendekati DNA.

Urutan palindromik juga meningkatkan kemungkinan kedua untai DNA dipotong. Bahkan dimungkinkan bahwa dua enzim bekerja sebagai dimer untuk memotong urutan palindromik, yang semakin meningkatkan efisiensi.

Alasan terakhir penting dalam perjuangan antara virus dan bakteri. Bakteri telah berevolusi untuk 'menonaktifkan' virus penargetan bakteri (bacteriophage) menggunakan enzim restriksi yang berikatan dengan urutan palindromik ini. Memotong kedua untai DNA lebih merusak virus daripada memotong satu untai.