Apa yang mungkin menjadi masalah jika band tidak muncul di Western Blot?

Apa yang mungkin menjadi masalah jika band tidak muncul di Western Blot?
Anonim

Menjawab:

Banyak…

Penjelasan:

Ada banyak alasan mengapa band mungkin tidak muncul di western blot. Apakah kombinasi sampel dan antibodi berhasil di masa lalu?

Berikut adalah beberapa yang dapat saya pikirkan saat ini yang dapat menyebabkan band tidak muncul:

  1. Apakah protein dipindahkan dari gel? Cobalah pewarnaan selaput dengan sesuatu seperti ponceau S atau amido hitam untuk melihat apakah ada band. Terkadang, Anda dapat melihat pita protein pada membran dengan membasahi dan memegangnya pada sudut ke cahaya.

  2. Apakah antibodi primer berfungsi? Ini adalah tes yang sulit dan satu-satunya cara Anda bisa adalah dengan memasukkan kontrol positif di mana Anda tahu Anda memiliki protein yang menarik. Jika Anda memiliki beberapa protein yang menarik, Anda dapat mencoba melihatnya di membran Western blotting (mis. Anda tidak menjalankan gel) dan melihat apakah Anda mendapatkan hasil jika Anda memproses membran seolah-olah itu adalah western blot.

  3. Apakah antibodi sekunder mengenali antibodi primer? Sekali lagi, yang sulit untuk diuji. Tentang satu-satunya tes yang dapat Anda lakukan adalah tes spot yang disebutkan di atas dalam 2.

  4. Apakah "sistem deteksi" berfungsi? Bergantung pada metode pendeteksian yang Anda gunakan, Anda bisa mencoba melompati beberapa antibodi sekunder untuk melihat apakah solusi pendeteksiannya, dan juga zat pemicu / enzim pada antibodi sekunder, berfungsi. Yaitu, dapatkah Anda memicu reaksi hanya dengan antibodi sekunder?

Akhirnya, itu bisa sesederhana salah satu solusi yang digunakan selama penyelidikan plot yang dibuat secara tidak benar. Misalnya, jika konsentrasi garam salah dalam buffer maka ini dapat menyebabkan antibodi dilepaskan dari noda. Hal yang sama juga akan terjadi jika pH buffer salah.

Penyebab "paling aneh" untuk noda barat yang tidak berfungsi yang saya alami alami adalah ketika kami mengganti pemasok susu bubuk yang kami gunakan untuk memblokir membran. Serbuk dari pemasok baru itu mengandung fosfatase fosfotyrosin yang menghilangkan semua gugus fosfat yang kami coba deteksi dengan antibodi anti-fosfotyrosin kami.